Etelä-Savon metsien terveydentila on varsin hyvä. Metsikön laatuun vaikuttavia vakavia tai täydellisiä tuhoja on valtakunnan metsien inventoinnin mukaan ollut kahdella prosentilla metsämaan pinta-alasta. Lieviä metsätuhoja on kuitenkin joka viidennellä metsähehtaarilla. Eniten ovat lisääntyneet eläin- ja sieni tuhot. Havupuiden harsuuntuminen ei ole merkittävä ongelma alueella.

Juurikääpä vitsauksena

Etelä-Savossa juurikäävän esiintyminen männiköissä on erityisesti Saimaan lähiympäristön ongelma.Kesäaikainen korjuu ja korjuuvauriot ovat lisänneet juurikäävän saastuttamien metsien määrää. Viimevuosina juurikäävän torjunta kesäaikaisissa hakkuissa on lisääntynyt merkittävästi. Vanhoilla kaskimailla ja metsälaitumilla esiintyy kuusikoissa lähinnä boorin puutteesta johtuvia kasvuhäiriöitä.

Hirvi haittana taimikoissa

Hirvi ja erilaiset sienitaudit ovat merkittävimpiä puustovaurioiden tai tuhojen aiheuttajia. Hirvituhoja on noin kolmasosalla Etelä-Savon mänty- ja koivutaimikoista. Tuhojen takia varsinkin hirvien talvehtimisalueillamännyn ja koivun kasvattaminen ei ole mahdollista, vaan joudutaan turvautumaan usein kasvupaikallesopimattoman kuusen kasvatukseen. Tuhoista aiheutuu hyvin merkittäviä kasvu- ja laatutappioitasekä tulonmenetyksiä metsänomistajille.

Muita metsätalouden kannalta merkittäviä tuhonaiheuttajia ovat myyrät, hyönteiset sekä myrsky jalumituhot. Niiden määrä vaihtelee vuosittain voimakkaasti.